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最后，标准的软件程序如ATLAS.ti.5，Nvivo和QDA Miner可用于定性研究方法中的自动编码过程。这些程序可以根据用户定义的规则快速有效地组织、寻找、归类与处理大宗的文本数据。为了给自动分析提供指引，研究者需要制定一个编码规则，在对样本文本数据进行初始的收到分析后明确在对文本进行搜索时的关键词或代码。编码规则可以按层级将代码分为高阶代码或变量。需要利用一个不同的文本样本对编码规则验证其精确性与充分性。如果编码规则出现偏误或不准确，那么对于整个总体文本的分析将存在严重缺陷，而难以作出解释。不过，软件程序并不能破译某些字词、短语或这些字词或短语的应用情境（如在反讽或隐喻中）的意义，这将导致大规模定性分析的显著的错误诠释。
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