当一个研究者考虑案例研究方法时，其需要考虑如下几项重要决定。第一，这种方法是否是解决研究问题的正确的方法？案例研究方法适用于那些用于在理论形成阶段发现相关变量的研究，适用于那些参与者经验与行为的情景至关重要的研究，适用于那些旨在理解复杂的时序过程（如为什么现象会发生或现象如何发生）而非因素或原因（关于什么）的研究。这种方法对于涉及多个参与者与多个连续事件的复杂的组织过程（如组织变革或大规模的技术实施项目）的研究更为适用。
第二，案例研究的合适的分析单元是什么？因为案例研究可以同时考查多个分析单元，所以研究者必须决定其研究对象是个体层面、群组层面、组织层面还是多层面的现象。例如，一个关于群决策或群协作的研究可能会整合个体层面的变量（如个体参与组活动的行为）与组层面的变量（如小组凝聚性和领导风格）从而获得比单层面分析更丰富的理解。
第三，研究者应该采用单个案例还是多个案例的设计？单个案例设计更适合于理论创造型的研究，特别是当此个案是独特或极端情况时，当其具有启示性时（即该情况在以前的科学研究中不太容易出现时），或当其是一种批判性的或与成熟理论相违背的案例时。多案例设计对于理论检验更为适用，因为其可以增加结论的广义性，并且可以对现象进行更为丰富与详尽的表述。殷（1984） 1 依据重复性的逻辑建议采用多案例站点，将每个案例站点视作一个实验研究，遵循实证研究中的科学严谨性原则。
第四，应该选择什么案例研究站点？由于案例研究结论的情境化的本质，站点选择非常重要，因为选择错误的站点将导致错误的结论。如果研究目的是对理论进行检验或者检验结论的广义性，那么应该选择不相像的站点以增加观测的方差。例如，如果研究目的是理解企业的技术实施过程，应选择混合大型、中型与小型企业的站点以检验技术实施过程是否因企业规模而不同。站点选择不应抱乐观态度或基于便利性原则，而应该与研究问题所匹配，这个过程称之为“理论化抽样”。
第五，案例研究应该采用什么数据收集技术？尽管访谈（开放化/非结构化或封闭式/结构化）是至今案例研究最为流行的数据收集技术，访谈数据可以与其他技术相结合，例如直接观察（如参与执行层会，传达指示会，和规划会）、文件整理（如内部报告，演讲，备忘录，以及外部新闻报道等）、档案记录（如组织图表，财务记录等）和物理用品（如设备，输出，工具等）。此外，研究者可以通过比较来自不同受访者的回答来验证观测数据。
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